组织协调工作是贯穿于设备工程项目实施的全过程的。在设备工程监理组织协调的具体工作上，总监理工程师处于组织协调工作的中心地位并起到领导作用。
(一)设备监理单位和设备监理机构之间以及设备监理机构内部的组织协调
1.设备监理机构与所属设备监理单位之间的组织协调。
设备监理机构是设备监理单位派驻现场的执行机构。
总监理工程师应与所属设备监理单位保持密切的联系，接受设领导和业务指导，执行各项规章制度，服从调度，完成企业计划和管理目标，经常汇报工作，及时反映问题，在需要时请设备监理单位领导出面进行组织协调。
2.设备监理机构内部的组织协调
总监理工程师应以主动工作方式为主，应采用民主的工作作风，应对每个监理人员量才使用，加强培训和教育。
在工作安排上要职责分明，实事求是。设备监理机构各类人员之间在工作上应互相支持。
总监理工程师还应做好设备监理机构内部各层次(总监理工程师、总监理工程师代表、专业监理工程师、一般监理人员和其他工作人员)之间、各专业之间的组织协调工作，使项目监理工作和谐、有序、高效地进行。
(二)设备监理单位与业主之间的组织协调
应首先维护业主的法定权益。应充分尊重业主，加强与业主领导及其驻工地授权代表的联系与协商。在进行重要的监理活动前，应征求业主的同意。
设备监理工程师与业主的关系是建立在有关法律和职业道德的基础上的，当业主不能听取正确的意见，或坚持不正当的行为时，总监理工程师应采取说服与劝阻的方式，必要时可发出备忘录，以记录在案，并明确责任，对于重大问题还应及时向所属设备监理单位领导报告。
总监理工程师应坚持原则，业主与承包单位之间凡是与设备工程合同有关的活动，必须通过设备监理机构同意或备案后再实施，否则总监理工程师将失去其组织协调工作的主动权。
(三)设备监理单位与设计单位之间的组织协调
是否对设计阶段进行监理，这取决于业主的委托范围。以委托合同为准。设备监理单位与设计单位之间有两种关系，
一是监理和被监理的关系，可以归入监理与承包商之间的组织协调。
二是业务上的关系。
设备监理工程师与设备设计工程师之间、总监理工程师与设备工程项目设计总负责人之间，应互相理解、尊重并密切配合。如设备监理工程师认为设计中存在不足之处，应通过业主向设计单位提出建设性的意见，供设计工程师参考。
设备监理工程师无权修改设计，设计的修改必须通过设计单位，同时设备监理工程师应配合设计单位做好工程变更工作。
(四)设备监理单位与承包商之间的组织协调
监理单位与制造、安装承包商之间是监理与被监理的关系。
在涉及承包商的正当权益时，监理单位应站在公正的立场上予以维护。
工程质量不符合规定时，一定要坚持原则，拒绝验收，总监理工程师拒签工程款的支付凭证。
监理与承包商始终不应发生经济关系。
(五)设备监理单位与其他监理单位之间的组织协调
建设监理之间要加强联系、互相尊重、互相配合，划分清楚各自的监理范围与界限。建立双方总监理工程师的协商制度，共同完成监理任务。
不好划分的，由双方协商以一方为主，另一方密切配合，共同对工程质量、进度、造价等的文件进行签认，竣工后由双方共同验收。
(六)设备监理单位与有关政府主管部门及公共事业管理部门之间的组织协调
与这些部门的联系与协调主要是业主和承包商的工作，设备监理机构可给予必要的协助。
(七)设备监理单位与政府有关的质量监督部门之间的组织协调。设备监理单位与政府有关的质量监督部门之间是监督与指导的关系。
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